


Palvelun nimi | RNA-sekvensointidatan analyysi |
Palveluntarjoaja(t) | Laskennallisen lääketieteen keskus, Turun biotiedekeskus, Turun yliopisto |
Asiakas | RNA-sekvensointidatoja teettävät yksityiset tai akateemiset toimijat |
Kesto | Data-analyysitulokset toimitetaan pääsääntöisesti kalenterikuukauden sisällä raakadatan toimituksesta. |
Hinta | Kysy tarjous |
Aloitus | Palvelu päästään aloittamaan noin viikon sisällä projektin sopimisesta, riippuen raakadatan toimitusaikataulusta. |
Kuvaus | Illumina-laitteilla tuotetun ihmis-, hiiri- tai seeprakalanäytteistä peräisin olevan RNA-sekvensointidatan perusanalyysi sisältää seuraavat kohdat:
– Aloituspalaveri – Aineiston laaduntarkistus – Sekvenssien linjaus referenssigenomiin ja geenitason signaalien kvantitointi – Geeniekspressioerojen testaus näyteryhmien välillä ja kandidaattigeenien poiminta – Funktionaalinen analyysi – Kattava raportti tehdyistä analyyseistä ja tulostiedostoista – Tulospalaveri |